江梦雨S
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- 【原创】 【重磅】22日,一项关乎亿万人未来的重大工程在中国诞生了
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【重磅】22日,一项关乎亿万人未来的重大工程在中国诞生了
今天,我国的国家基因库将正式投入运行。这是继美国、日本和欧盟之后,全球第四个建成的国家级基因库,也是目前为止世界最大的基因库。
新国家基因库今天正式运营
我国的国家基因库相当于很多的国外的基因库和数据库的集合,它包括生物信息的数据库、生物样本的资源库还有生物活体库,存储管理我国特有的遗传资源、基因数据和生物信息。是目前全球最大的综合性基因库。
美国、欧盟、日本已建立三大基因数据库,几乎涵盖了所有已知的DNA、RNA和蛋白质数据。我国的基因库在他们的基础上融合近年来生命科学前沿技术,形成 “三库两平台”的结构及功能。“三库”由贯穿全生命周期的基因信息数据库、生物样本资源库和生物活体库组成,“两平台”为数字化平台、合成与基因编辑平台。
国家基因库已实现对基因信息数据总量达60PB的访问支持,9月22日是正式运营的第一天,有5PB的数据正式对外发布,提供数据检索和查询功能。目前数据产量将达到每年5PB,相当于1000万人产前筛查的数据产出规模,升级后的系统预计年产数据可达10PB。
国家基因库里有什么?
在基因时代,这样的未来可期:到医院看病,只需自己的基因作为“身份证”和病历;想“返老还童”,保存完好的干细胞就能轻松搞定;憨态可掬的大熊猫不再稀奇,就在你家庭院里懒洋洋地打盹;远古的恐龙、猛犸象不只活在特效里,它们在博物馆奇妙之夜真实复活……
通向这样的未来,需要一些坚实的“砖石”——生物样本和数据。这正是我国唯一一座国家基因库的定位:有效保护、开发、利用遗传资源,提高我国生命科学研究和生物产业发展水平,维护国家生物信息安全,助力全球生命科学发展。
2011年,国家发改委等4部委批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库。
△深圳国家基因库主体工程已建成(俯瞰图)
国家基因库位于深圳市大鹏新区观音山脚下,一期占地面积4.75万平方米。从外形上看成台阶形,外形参照哈尼梯田设计而成。这个外观仿若巨大梯田的建筑非常具有标志性,面朝大海,三面环山,与外界相对独立,每一层建筑都倚着山体的自然坡度建设,与自然融为一体。基因库有山体结构的支撑,稳固性非常好,可以摆放一些较重的设备。
走进建在层层梯田之上、室内绿意盎然的建筑,从一层上三层,依次会看到庞大的高通量基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房。
△国家基因库的150台基因测序仪
△冷库
国家基因库核心:“三库两平台”
“三库两平台”,是国家基因库主任梅永红描述基因库内容时使用频次最高的一个概念。
据梅永红介绍,与美国、欧盟、日本其他三大世界级的基因库不同,中国国家基因库不仅仅是数据库,而是国际上现有的各类生物样本库、数据库、生物多样性库、疾病库等的综合升级版。
除了“干库”(即基因、蛋白、分子、影像等多组学生物信息数据库)、“湿库”(多样性生物样本和物种遗传资源库)之外,国家基因库还引入了“活库”,即生物活体库,包括动物资源、植物资源、微生物资源和海洋资源等。
不妨把它想象成这样一个载体:它是人类博物馆、植物园、动物园、海洋馆、微生物馆的集合,这里存储的将不仅是一个个标本原型和实物,还有一粒种子、一个细胞、一管血液、一口唾沫、一段脱氧核糖核酸、一条数据……
△8月10日,国家基因库细胞存储平台中级实验师郑东敏将人源组织细胞样本经过培养,放入零下196摄氏度的液氮当中保存。
“两平台”指的是数字化平台和合成与编辑平台。“三库两平台”的建设,最终为的是解决生命数据的“存、读、懂、写、用”5个作用。
“通俗地说,就是我们要把全球的生物资源都收集起来,用测序仪读取万物的遗传数据,用超级计算机算出结果,用合成与编辑平台写出生命代码,最后用来为人类服务。”梅永红说。
国家基因库像我们的“生命银行”
“高大上”的国家基因库看似很遥远,但其实跟每个人都息息相关。华大基因董事长汪建说,每个人一生中所有关键阶段的标本都应该永久保存起来:从出生时的干细胞,到20岁时的免疫细胞,到30岁时的生殖细胞……而国家基因库,就是储存这些样本和数据的地方,像我们的“生命银行”。
“这类似于在人生的不同阶段给自己拍照片,如果我们不拍,那就永远拍不到了。”汪建说,“老照片只能拿来做留念,但是我们在不同阶段存进‘生命银行’的年轻样本,却是在我们越老的时候越有用,甚至可能在关键时刻救命。”
存储这些数据到底有什么作用?从数年前开始,汪建就开始有意识地存储自己的健康数据。这样做的结果是,他对自己身体变化状况了如指掌,并且根据这些数据设计自己的饮食、运动和生活节奏,“对抗”衰老。他说,随着国家基因库存储容量的增加,未来将会有更多人可以储存和掌握自己的健康数据,过上更健康的生活。
△工作人员在国家基因库操作基因测序仪测序
除了对个人,国家基因库对保护生物多样性也有重要意义。目前,保护人类生存环境,保护物种的多样性已刻不容缓。汪建说,对濒危的生命物种,我们需要尽快地将这些资源存储起来,向子孙后代做一个交代。
生命的“国库”,开放的平台
人类越来越认识到基因资源以及保护地球生物多样性的重要。国际上,挪威斯瓦尔巴全球种子库、美国自然历史博物馆、英国生物样本库等应运而生,尤其是美国、欧洲、日本先后建立了大型基因数据库,这三大库里的生物信息数据几乎涵盖所有已知的脱氧核糖核酸、核糖核酸和蛋白质数据。
国家基因库执行主任徐讯说:“中国亟须这样一个平台,从国家层面对具有中国特色的生物样本和基因数据进行有效保存、管理和合理利用。”
“基因库是生命科学的‘国库’,比银行的金库还要宝贵。”梅永红说,农耕时代的核心资源是耕地,工业时代是能源,而生命科学时代则是基因。基因资源目前已成为重要的国家战略资源,如精准医学很大程度上依赖对基因解读的结果。“未来精准医学方面的发展和竞争,一定程度上是基因资源的获得与解析”。
目前,国家基因库已与国外多个国家级自然历史博物馆、挪威世界末日种子库等机构建立合作,正式运营以后,也将与国际DNA数据库三方组织一样开放数据共享平台。
△9月20日,一名工作人员打开国家基因库零下4摄氏度冷库的门。
新闻链接——基因:生命的语言
建立这样的大型基因库到底有什么样的用处,它又会有多大的产业潜力呢?
地球上几乎每个生命都有DNA,未折叠的DNA有6英尺长,比头发丝还要细30000倍。带有蛋白质编码的DNA片段称为基因。
而一个生命个体中所有DNA的集合又被称为基因组。
基因组中2%的基因负责编码蛋白质,30%的基因调控这个过程,基因组造就出地球上最复杂和高等的人类,基因突变让你我彼此不同。通过基因研究,我们可以追根溯源,探索生命的起源。
而在现代医疗中,通过基因测序就我们就能查找病源或预测患上疾病的几率。新型的基因靶向疗法更有可能为癌症、肿瘤等疑难病症提供新的治疗方法。2015年,美国宣布了精准医学计划。我国也将精准医疗写入了“十三五”规划,将投资30至40亿元构建精准医疗系统。
作为全球发展最快的市场之一,基因测序在中国未来两三年都将保持20%-25%的复合增长,未来5年的市场规模将达到百亿级。
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22日,我国的国家基因库将正式投入运行。这是继美国、日本和欧盟之后,全球第四个建成的国家级基因库,也是目前为止世界最大的基因库。
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